復旦大學創建于1905年，原名復旦公學，是中國人自主創辦的第一所高等院校，創始人為中國近代知名教育家馬相伯。“復旦”二字選自《尚書大傳·虞夏傳》中“日月光華，旦復旦兮”的名句，意在自強不息，寄托當時中國知識分子自主辦學、教育強國的希望。1917年復旦公學改名為私立復旦大學，下設文、理、商三科以及預科和中學部。1929年學校始設文、理、法、商四個學院，下轄16個系。1940年設立農學院。1937年抗戰爆發后，學校內遷重慶北碚，并于1941年改為“國立”。1946年遷回上海江灣原址。1952年全國高等學校院系調整后，復旦大學成為文理科綜合大學，1959年成為全國重點大學。2000年復旦大學與上海醫科大學合并，成立新的復旦大學。

   上海醫科大學創建于1927年，是中國人自主創辦的第一所高等醫學院校。建院時定名為第四中山大學醫學院，1932年改名為國立上海醫學院，1952年更名為上海第一醫學院，1959年成為全國重點大學，1985年改名為上海醫科大學。上海醫科大學與復旦大學的合并，進一步拓寬了復旦大學的學科結構，為綜合性大學的發展目標奠定了堅實的基礎。

   歷經幾代復旦人的艱苦創業和努力奮斗，尤其是20世紀80年代以后，復旦大學進入快速發展時期。通過教育部和上海市共建，“七五”和“八五”的重點建設、“九五”和“十五”“211工程”、“985工程”的重點建設，復旦大學逐步發展成為一所包含哲學、經濟學、法學、教育學、文學、歷史學、理學、工學、醫學、管理學十個學科門類的綜合性研究型大學。

   2009年，學校有普通本專科生、研究生26 362人；留學生3 633人（其中攻讀學位的留學生2 531人）；另有成人教育、網絡教育本專科生18 664人。有專任教師2 426人、專職科研人員252人，其中高級職稱1 649人。有中國科學院、中國工程院院士36人，教育部“長江學者獎勵計劃”特聘教授53人、講座教授30人，“國家重點基礎研究發展計劃（含重大科學研究計劃）”項目首席科學家17人。有直屬院（系）28個，設有本科專業70個，一級學科博士學位授權點24個，博士學位授權學科、專業點154個（其中自設30個，專業學位1個），碩士學位授權學科、專業點229個（其中自設51個，專業學位10個），并設有29個博士后科研流動站。有11個一級學科國家重點學科、19個二級學科國家重點學科。有國家重點實驗室4個，教育部工程研究中心4個，教育部重點實驗室13個，衛生部重點實驗室9個，上海市重點實驗室6個，“985工程”科技創新平臺5個，“985工程”哲學社會科學創新基地7個。

   學校已經形成“一體兩翼”的校園格局：即以邯鄲校區、江灣新校區為一體，以楓林校區、張江校區為兩翼。占地面積244.32萬平方米，校舍建筑面積141.05萬平方米。此外，學校還擁有中山醫院、華山醫院等10個附屬醫院。

   一百多年來，學校在培養人才、創新科技、傳承文明、服務社會方面為國家作出突出貢獻。復旦師生謹記“博學而篤志，切問而近思”的校訓；嚴守“文明、健康、團結、奮發”的校風；力行“刻苦、嚴謹、求實、創新”的學風，發揚“愛國奉獻、學術獨立、海納百川、追求卓越”的復旦精神，為民族的解放和振興，國家的建設和發展，社會的文明和進步作出重要貢獻。2005年復旦大學百年華誕。中共中央總書記、國家主席、中央軍委主席胡錦濤發來賀信，中共中央政治局常委、全國人大常委會委員長吳邦國出席百年校慶慶祝大會并發表重要講話，中共中央政治局常委溫家寶、賈慶林、曾慶紅、黃菊、吳官正、李長春、羅干以各種方式對復旦百年校慶表示祝賀。2006年學校制定了《復旦大學“十一五”發展規劃綱要》，以堅持內涵發展為主導，以增強綜合實力為主線，以爭取重大突破為方向，向建設世界一流大學的目標大步邁進。